岩谷 約20,600 羽後国由利郡岩谷邑発祥、清和源氏小笠原氏族。ほか藤原氏（岩代）、水口藩士に。

高畑 約21,100 石見国邑智郡高畑邑発祥の清和源氏小笠原氏流。ほか大神氏、越智氏、平氏など。

内村 約22,000 信濃国小県郡内村邑発祥の清和源氏小笠原氏流。ほか藤原氏秀郷流など。

石沢 約24,800 清和源氏小笠原氏流、後裔に庄内藩士。ほか平氏など。会津藩、郡山藩、飯田藩に。

大倉 約30,800 信濃国水内郡発祥の清和源氏小笠原氏流。ほか桓武平氏、藤原氏、坂上氏など。

水上 約34,800 甲斐国山梨郡水上発祥の清和源氏小笠原氏流。ほか藤原氏など。

大西 約182,000 阿波国三好郡大西村発祥の清和源氏小笠原氏流。稲荷祠官は秦姓。

内山 約105,000 信濃国佐久郡発祥の清和源氏。陸軍大将内山男爵は旧鳥取藩士。諸流多し。

三好 約74,500 阿波国三好郡発祥の清和源氏小笠原氏流が主流。ほか藤原氏公季流など諸流。